中國科學(xué)院成都生物研究所兩棲爬行動(dòng)物、植物標(biāo)本館
成都生物所兩棲爬行動(dòng)物、植物標(biāo)本館是在該所原植物標(biāo)本館（建于1958年）和兩棲爬行動(dòng)物標(biāo)本館（建于1965年）的基礎(chǔ)上合并而成，是集科研、標(biāo)本保藏、展覽、學(xué)術(shù)交流等功能為一體的具有國內(nèi)先進(jìn)水平的標(biāo)本館，在兩棲爬行動(dòng)物分類、系統(tǒng)演化方面的研究達(dá)到亞洲領(lǐng)先水平。
中國科學(xué)院植物研究所植物標(biāo)本館
亞洲最大的植物標(biāo)本館，目前館藏臘葉標(biāo)本愈220萬號，并妥善保藏了1萬余份模式標(biāo)本。還有8萬號種子標(biāo)本和7萬號化石植物標(biāo)本。
中國科學(xué)院微生物研究所菌物標(biāo)本館
目前保藏標(biāo)本40多萬號，其中已定名標(biāo)本為19萬號，2萬余種，已定名標(biāo)本采自中國以及111個(gè)國家，南極大陸和北極圈內(nèi)地區(qū)。
中國科學(xué)院武漢病毒研究所中國病毒標(biāo)本館
中國科學(xué)院武漢病毒研究所創(chuàng)建了具有現(xiàn)代化展示手段的我國唯一的“中國病毒標(biāo)本館”，集學(xué)科性、特色性和科普性于一體，是第一批“全國青少年走進(jìn)科學(xué)世界科技活動(dòng)示范基地”。
中國科學(xué)院武漢植物園標(biāo)本館
始建于1956年，主要收藏湖北及華中地區(qū)植物標(biāo)本�，F(xiàn)館藏模式標(biāo)本約200份，蕨類植物標(biāo)本5100份，裸子植物標(biāo)本2700余份，被子植物標(biāo)本191500份。
中國科學(xué)院華南植物園標(biāo)本館
收集積累了維管束植物標(biāo)本超過100萬號，其中有種子植物85萬號、苔蘚植物4萬號、蕨類植物4萬號、模式標(biāo)本近7000號、復(fù)份標(biāo)本8萬號，液浸標(biāo)本6400號，使標(biāo)本館得到長足發(fā)展，成為全國三大植物標(biāo)本館之一。
中國科學(xué)院昆明植物研究所標(biāo)本館
標(biāo)本館現(xiàn)收藏植物標(biāo)本110.0萬份，是國內(nèi)收藏植物類群較全（涵蓋除藻類以外的所有植物門類）的標(biāo)本館，收藏的植物標(biāo)本來自全國，尤以西南及東喜馬拉雅地區(qū)的最為豐富。本館在中國乃至世界植物學(xué)研究、資源的開發(fā)利用及生物多樣性保護(hù)方面具有重要的地位，是中國植物學(xué)研究的重要基地。
中國科學(xué)院西雙版納熱帶植物園熱帶植物標(biāo)本館
標(biāo)本館是西雙版納熱帶植物園科研系統(tǒng)中技術(shù)支撐機(jī)構(gòu)之一，對本園學(xué)科發(fā)展提供技術(shù)支撐服務(wù)，同時(shí)也為地方林業(yè)，環(huán)保，園林，海關(guān)，公安和科普等社會(huì)事業(yè)提供技術(shù)服務(wù)。
共存儲裝訂標(biāo)本125013份。其中被子植物標(biāo)本111137份，裸子植物標(biāo)本700份，蕨類植物標(biāo)本13158份，苔蘚植物標(biāo)本18份，國內(nèi)標(biāo)本117606份，絕大部分為本館在滇南地區(qū)采集；國外標(biāo)本有7407份，主要通過與泰國，越南，柬埔寨等東南亞國家的國際合作項(xiàng)目及標(biāo)本交換獲得。
中國科學(xué)院西北高原生物研究所青藏高原生物標(biāo)本館
標(biāo)本館作為目前收藏、保存青藏高原這一特殊區(qū)域的生物標(biāo)本數(shù)量最多、種類最全、館藏最豐富的標(biāo)本館，其獨(dú)有的青藏高原特色，在全國乃至世界范圍內(nèi)都是無可替代的。
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