中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院植物生理生態(tài)研究所上海昆蟲博物館
現(xiàn)收藏全國(guó)各地昆蟲標(biāo)本100多萬(wàn)號(hào)，保藏著一大批瀕危珍稀昆蟲標(biāo)本及國(guó)際和國(guó)內(nèi)的危險(xiǎn)性檢疫害蟲標(biāo)本，系統(tǒng)地介紹了昆蟲的起源、演化、形態(tài)特征、生活習(xí)性、昆蟲家族等是我國(guó)大型的專業(yè)昆蟲館。
中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所淡水魚類博物館
目前亞洲規(guī)模最大、收集種類最多的淡水魚類博物館，是中國(guó)科學(xué)院在國(guó)內(nèi)具有較好基礎(chǔ)的優(yōu)勢(shì)學(xué)科之一。通過(guò)幾十年的工作，已經(jīng)收藏了大量的水生生物標(biāo)本以及相應(yīng)的科學(xué)積累。
中國(guó)古動(dòng)物館
屬自然科學(xué)類專題博物館，1994年10月正式開放。它是一座系統(tǒng)介紹脊椎動(dòng)物起源和系統(tǒng)發(fā)育的國(guó)家級(jí)博物館。
中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所國(guó)家動(dòng)物博物館
國(guó)家動(dòng)物博物館位于中國(guó)科學(xué)院奧運(yùn)村園區(qū)動(dòng)物研究所內(nèi)，是國(guó)內(nèi)外公認(rèn)的、亞洲最大、研究水平最高、綜合實(shí)力最強(qiáng)的動(dòng)物系統(tǒng)分類與進(jìn)化研究中心，還將借鑒現(xiàn)代化博物館的主題展示法，采用自然科學(xué)與人文科學(xué)等多學(xué)科的知識(shí)集中體現(xiàn)主題，引入4D動(dòng)感影院等高科技視聽設(shè)施，讓深?yuàn)W的科學(xué)哲理變得更加平易近人。
中國(guó)科學(xué)院南京地質(zhì)古生物研究所南京古生物博物館
中國(guó)科學(xué)院和江蘇省共建的南京古生物博物館于2005年12月31日向社會(huì)非正式開放，大批南京市民和學(xué)生以及學(xué)齡前兒童來(lái)到博物館，參觀和了解地球和生命進(jìn)化的故事。新完成的博物館以古生物化石為本，以古無(wú)脊椎動(dòng)物、古植物和微體古生物為主，是目前世界上最大的古生物專業(yè)博物館之一。博物館藏品豐富，展品精美，其中尤以“澄江動(dòng)物群”和包括“中華龍鳥”在內(nèi)的“熱河生物群”化石標(biāo)本最為珍貴，堪稱國(guó)寶級(jí)的化石精品。整個(gè)展覽講述一個(gè)地球和生命演化歷史的故事，內(nèi)容包括一個(gè)“生命的進(jìn)化” 主題展和十四個(gè)專題展。展覽引人入勝，精彩生動(dòng)，寓教于樂。
中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所昆明動(dòng)物博物館
昆明動(dòng)物博物館是中國(guó)科學(xué)院國(guó)家知識(shí)創(chuàng)新工程的重要項(xiàng)目及中國(guó)科學(xué)院重點(diǎn)支持的兩大博物館之一，博物館通過(guò)動(dòng)物的姿態(tài)標(biāo)本、骨骼標(biāo)本、皮張標(biāo)本、浸泡標(biāo)本、生態(tài)景觀等，按照動(dòng)物的進(jìn)化、生息和分布規(guī)律，集中反映這些動(dòng)物的特征、習(xí)性、分布等，體現(xiàn)物種和生境的多樣性、生物與環(huán)境的統(tǒng)一、人與自然的和諧。
中國(guó)科學(xué)院西雙版納熱帶植物園熱帶雨林民族文化博物館
博物館位于中國(guó)科學(xué)院西雙版納熱帶植物園園內(nèi)，面積2000平方米，外觀體現(xiàn)了傣族建筑的風(fēng)格。館轄熱帶雨林、民族森林文化展廳和熱帶雨林民族文化研究中心等，是一個(gè)集公眾教育、科學(xué)研究和文物保存等功能的專業(yè)性博物館。